Priorytetową działalnością MSHM jest badanie i ochrona dziedzictwa pradziejowego na terenie zachodniego Mazowsza ze szczególnym uwzględnieniem Mazowieckiego Centrum Metalurgicznego. Szczególną troską otaczamy wszelkie działania mające na celu zachowanie tradycji, pamięci oraz dziedzictwa kulturowego.

Swoistą misją Muzeum jest promowanie i upowszechnianie zdobytej wiedzy archeologicznej i historycznej. Staramy się nie tylko nadać przekazywanym treściom wartość informacyjną, ale poprzez niestandardowe podejście do popularyzacji rozbudzić w społeczeństwie autentyczne zainteresowanie przeszłością. Dążymy do zwiększenia roli oraz wyrobienia nawyku świadomego odbioru i uczestnictwa w szeroko pojętej kulturze.