W filmie "Alarm na Wyspie Puffinów", ostatnie Małe Jajko na wyspie Puffin Rock znika, tworząc sytuację pełną napięcia i wyzwań. Młode maskonury, Oona i Baba, znane z popularnego serialu telewizyjnego "Wyspa Puffinów", stają przed zadaniem odnalezienia i zabezpieczenia jajka przed nadchodzącą burzą.

Początkowo zadanie wydaje się Oonie i Babie trudne, ale na szczęście nie są one same. Do akcji ratunkowej przyłącza się grupa ich wiernych przyjaciół: lisek Flynn, królik May i ryjówka Mossy. Na wyspie pojawiają się również nowe postacie: maskonurka Isabelle i jej przyszywany brat Phoenix, którzy szukają nowego domu po opuszczeniu rodzinnego gniazda. Mieszkańcy Puffin Rock szybko okazują im wsparcie i solidarność.

Razem, ta zgrana drużyna przeżywa przygody, pokonuje tęsknotę, zmaga się z trudnymi warunkami pogodowymi i stawia czoła natrętnym mewom. Film jest pełen emocji, przyjaźni i poczucia wspólnoty, ukazując wartość współpracy i siłę grupy w pokonywaniu przeszkód.